Typy sestřihu RNA: Podrobná fakta

Sestřih RNA je metoda v oblasti molekulární biologie, při které se nově vytvořená prekurzorová transkripce RNA převádí na zralou mRNA.

Existuje několik způsobů, jak sestřih RNA probíhá přirozeně, a je založen na typu sestřihu na bázi intronu a použitém katalyzátoru, který k tomu má napomáhat. Typy sestřihu RNA jsou

Self-splicing

Je to typ sestřihu RNA, který se odehrává v několika vzácných intronech, které jsou schopny pomoci podporovat mezery fosfodiesterových vazeb.

Tento typ nebo mezera pomáhá při vytváření fosfodiesterové vazby bez použití jiných proteinů nebo zbývajících spliceosomů. Introny, které jsou v něm zahrnuty, jsou jedinečné, protože budou schopny zprostředkovat excizi z prekurzorové RNA a ligaci následného lemování exonů ve velmi jednoduchém solném pufru.

Tato reakce je samosestřihová a pracuje na ní terciární část intronu, která má pomoci při vytváření báze pro intron a pomáhá mu se schopností rozpoznat místa sestřihu pro prekurzorovou RNA a pomoci mu provést ligaci a řeznou část přesným možným způsobem.

Vzor, který je v těchto intronech, je schopen fungovat jako ribozym, který pomůže při regulaci celý proces. Existují skupiny provedené pro tuto část sestřihu RNA a jsou označovány jako skupina I, skupina II a skupina III. Funkce každé skupiny jsou stejné, ale zároveň se liší.

Introny skupiny I a skupiny II pomáhají při výrobě stejného procesu u spliceosomů, lze říci, že introny jsou evolučně příbuzné se spliceosomy. V tomto okamžiku je 5' identifikován malým prvkem v intronech a nazývá se vnitřní průvodce sekvence. Skládá se ze dvou reakcí Tranovy esterifikace spojeného s odstraněním intronů a ligací exonu.

Kredit obrázku -
Vlastní spojování-Wikipedia

Střídavé spojování

Je to alternativní proces pro sestřih RNA v době genové exprese, který pomůže v jediném genu kódovat se pro ostatní proteiny.

Zde v tomto typu sestřihu RNA budou exony genu brány v úvahu z výsledné mRNA, která je vytvořena z genu. Uvádí, že exony, které jsou spojeny v několika kombinacích, vedou k různým vláknům messenger RNA.

Vyskytuje se v dobrém stavu v eukaryoty. Má zde schopnost zvýšit svou diverzitu proteinů, které mohou být také kódovány genomem. V nás, 95% z mnoha existujících genů jsou vytvořeny spoj střídat. Pro tento proces existuje mnoho uzlů, které lze vidět, přičemž nejobecnější formou je přeskakování exonu.

Tento proces je založen na systému, když působí na trans proteiny, které se spojí s cis pintou na primární přepis k sobě samému. Stejně jako to, proteiny slicked aktivátory také používají k podpoře použití konkrétního místa pro řez a obnovy spočívají v použití tohoto místa. Metoda pro tento proces je hodně variabilní a některé z těchto příkladů jsou také brány v úvahu především pro použití celého procesu.

Kredit obrázku -Střídavé spojování-Wikipedia

sestřih tRNA

Existuje mnoho intronů, které přerušují práci mnoha genů v eukaryotech, a proto jsou odstraněny sestřihem, což je zásadní krok v expresi genů.

V eukaryotech existují čtyři typy metod, které se používají. Messenger RNA probíhá ve fosfotransferové reakci na komplexu a dynamickém stroji. Tato funkce souvisí s mechanismem pro dva samosplicovací způsoby týkající se intronů skupiny I a skupiny II.

Ty ve skupině II jsou spojeny s identickým způsobem spojování, který pomáhá rozdělit společný prostor předků. tRNA genům je také umožněno katalyzovat všechny tři enzymy a proteiny a jsou vlastní veškeré potřebě hydrolýzy ATP.

Kredit obrázku -
sestřih tRNA-Wikipedia

Většinou v bakteriích, které se samy poskládají. Bylo vidět, že tento proces probíhá u eukaryot a archaea nesouvisí koupit jeho vidět nyní, že jako první zde použitý enzym je tRNA endonukleáza je vidět ve vývoji struktur, pokud archaea a eukaryota. Existuje mnoho vzpřímeně překvapeni byli viděni z boom, a tak zúžení se způsobem srovnání enzym od těchto dvou se značně liší.

Rekurzivní spojování typy sestřihu RNA

Rekurzivní sestřih (RS) je evolučně konzervovaný proces odstraňování dlouhých intronů prostřednictvím několika kroků sestřihu. Poprvé byl objeven u Drosophila a nedávno se prokázalo, že se vyskytuje také u lidí.

Sestřih RNA je proces eukaryotické genové exprese, při kterém je tato genetická informace modifikována jako RNA. Během sestřihu jsou specifické oblasti kopie RNA odštěpeny a sousední sekvence slepeny dohromady. Části genových sekvencí, které jsou exprimovány v proteinech, se nazývají exony, protože jsou exprimovány.

Sestřih RNA je proces eukaryotické genové exprese, při kterém je tato genetická informace modifikována jako RNA. Klíčový rozdíl mezi sestřihem RNA a substitučním sestřihem je ten, že sestřih RNA je proces spojování exonů hlavní kopie mRNA, zatímco alternativní sestřih je proces vytváření odlišných kombinací exonů stejného genu.

Trans-splicing

Je to zvláštní typ získávání procesu RNA. Zde jsou exony dvou typů, které jsou primárním transkriptem RNA, které jsou napojeny na konec konečné části, a druhý je ligovaný.

Jeho normální typ se nazývá cis typ a skládá se z jediné molekuly. Trans sestřih vytváří jeden RNA transkript z několika samostatných pre-mediátorových RNA. Tento způsob lze použít pro molekulární, kde pomáhají s mutovaným produktem genů.

Když existuje pohled na jakoukoli fúzi probíhající v transkriptech během normálního procesu v lidské buňce, jeho mechanismus působí za vznikem onkogenního transkriptu fúze. Na druhé straně jsou translatované proteiny vyrobeny na řezy a mají mnoho různých typů aminokyselinové sekvence a poskytují různé biologické využití.

Tento proces se také dostává do pomoci umožňující lidskému genomu přímou syntézu mnoha proteinů, což by měl být výsledek očekávaný od 20,000 genů kódujících proteiny. Transferové RNA jsou provedeny do přerušit introny ale proces spojování je ve skutečnosti jiný, protože pomáhá při jejich katalýze a vše se odehrává v Archaea, bakteriích a eukaryotech.

Co je sestřih RNA?

Sestřih RNA je způsob, který umožňuje použití jak prekurzorové, tak zralé RNA. Pomáhá tím, že odstraní introny.

Samotný proces sestřihu RNA začíná získáním spliceosomů nebo ribonukleoproteinů spojených s introny, které jsou vidět v místě sestřihu RNA. Toto spojení ribonukleoproteinů vzniká biochemickým způsobem a nazývá se transesterifikace mezi nukleotidy..

V sekci, kde je 3'OH, je příslušný nukleotid na vrcholu intronu, který je definován sestavením spliceosomu a výsledkem je útok nukleofilu na úplně první nukleotid intronu v místě 5' sestřihu. O spliceosomech se říká, že jsou jinou částí proteinové skupiny.

typy spojování rna
Kredit obrázku -
sestřih RNA-Wikipedia

To povede k tomu, že se konce 5' a 3' složí, takže to bude vypadat jako smyčka. Na druhou stranu, sousední části z exonů se také líbí dohromady. Nakonec je intronová smyčka ponechána oddělená od sekvence spliceosomů. Spliceosomy se také nazývají ribozymy a jsou in proces řízení a regulace.

Po tom všem 1st fáze, druhá transesterifikační reakce probíhá v době ligace přilehlého segmentu exonu. Tady, 3'OH část 5'exonu, který se uvolní a provede útok elektrofilní na samém začátku přítomného nukleotidu a přesně v místě posledního přítomného nukleotidu na intronu na 3' sestřihovém místě.

To způsobí slepení dvě části exonu s odstraněnou intronovou částí. Dříve byl samotný intron v době spojování držen venku a je považován za a jednotka harampádí. Přesto je nyní stále pozorováno, že jsou součástí metody, kde jsou proteiny ponechány k odstranění.

Přejděte na začátek