Nukleotidy ve struktuře RNA: Srovnávací analýza napříč It

by

Nukleotidy ve struktuře RNA jsou základní strukturní a funkční monomery, lépe řečeno stavební bloky nukleové kyseliny. Porovnejme všechny nukleotidy ve struktuře RNA a diskutujme o všech aspektech, které se jich týkají. 

RNA nebo ribonukleová kyselina je jeden polynukleotidový řetězec tvořený nukleotidy. Ve struktuře RNA se nacházejí čtyři různé nukleotidy, jako např.

Adenosinmonofosfát nebo AMP

Adenosinmonofosfát je jednou ze čtyř nukleobází, tvořených cukrem ribózapentózou, fosfátovou skupinou a nukleobází adeninem. Adenin AMP je purinová báze a tvoří vodíkové dvojné vazby s uracilem UM, což zvyšuje stabilitu.

Adenin AMP tvoří poly A konec RNA znamená, že RNA obsahuje na konci více adeninových zbytků. AMP může být přeměněn na ADP nebo ATP jako zdroj energie buňky. Jako cyklický AMP také řídí hormonální regulaci v buňkách.

Guanosin monofosfát nebo GMP

Guanosinmonofosfát je jedním ze čtyř nukleotidů ve struktuře RNA, typicky obsahující pětiuhlíkový ribózový cukr, fosfátovou skupinu a nukleobáze Guanin v něm. Guanin je purinová báze a vytváří vodíkové trojné vazby s cytosinem molekul CMP.

Je to důležitý monomer ve struktuře RNA. V 5-prvním konci RNA modifikovaná sekvence GMP nebo guaninu tvoří 5-prvkový uzávěr, který je důležitý pro ochranu nukleové kyseliny a pomáhá procesu zpracování a translace RNA. GMP také hraje významnou roli v signální transdukci a procesu hormonální regulace.

Cytidinmonofosfát nebo CMP 

Cytidinmonofosfát je také základní monomerní jednotkou RNA. Má tři složky, jako je ribózový cukr, fosfátová skupina a nukleobáze cytosin. Cytosin je pyrimidinová báze, která se páruje s guaninem GMP tvorbou vodíkových trojných vazeb. V přenosu signálu je role CMP nesmírná.

Uridin monofosfát nebo UMP

Uridinmonofosfát je monomerní nukleotid ve struktuře RNA. Je to nukleotid, který se nachází pouze v RNA, chybí ve struktuře DNA. Skládá se ze tří podjednotek, jako je ribózový cukr, fosfátová skupina a nukleobáze uracil. Uracil je derivát thyminu, který vytváří vodíkové dvojné vazby s adeninem. UMP také hraje zásadní roli v syntéze glykogenu.

Tyto čtyři nukleotidy ve struktuře RNA se na sebe vážou a dekódují specifické sekvence tvořící celou nukleovou kyselinu. Jelikož jsou přítomny různé druhy molekul RNA pro provádění různých buněčných aktivit, jsou v nich nukleotidy uspořádány podle jejich typu a podporují jejich specifické funkce. .

Nukleotidy ve struktuře RNA

Nukleotidy ve struktuře RNA z Wikimedia Commons

Srovnávací analýza mezi všemi nukleotidy ve struktuře RNA

 Všechny čtyři nukleotidy ve struktuře RNA mají mezi sebou určité podobnosti a rozdíly. Porovnejme všechny nukleotidy ve struktuře RNA s ohledem na všechny možné aspekty mezi nimi.

charakteristikaadenosinmonofosfát (AMP)Guanosinmonofosfát (GMP)Cytidinmonofosfát (CMP)Uridin monofosfát (UMP)
DefiniceAdenosinmonofosfát je nukleotid tvořený adenosinovým nukleosidem a jednou fosfátovou skupinou. Je to strukturální jednotka RNA, která se také používá jako energetická měna buňky.Guanosinmonofosfát je nukleotid složený z guanosinového nukleosidu a fosfátové skupiny. Je to strukturní jednotka RNA, která hraje klíčovou roli při překrývání RNA.Cytidinmonofosfát je nukleotid, který má ve své struktuře cytidinový nukleosid a fosfátovou skupinu. Slouží jako jeden ze stavebních kamenů RNA a stimuluje procedury přenosu signálu.Uridinmonofosfát je nukleotid, který se nachází pouze ve struktuře RNA, typicky složený z uridinového nukleosidu a fosfátové skupiny. UMP se většinou používá v procesu syntézy RNA.
Základní typPurinPurinPyrimidinPyrimidin
Doplňkový základuracilCytosinGuanineAdenine
StrukturaMá ve své struktuře adeninovou bázi, ribózový cukr a jednu fosfátovou skupinu.Má ve své struktuře guaninový základ, ribózový cukr a jednu fosfátovou skupinu.Má ve své struktuře cytidinovou bázi, ribóza-pentózový cukr a jednu fosfátovou skupinu.Obsahuje uracilový základ, ribóza-pentózový cukr a jednu fosfátovou jednotku.
DerivátyATPGTPCTPUTP
VzorecC10H14N5O7PC10H14N5O8PC9H14N3O8PC9H13N2O9P
HmotaX363.223 XNUMX g · mol-1323.198 XNUMX g · mol-1324.182 XNUMX g · mol-1
FunkcePůsobí jako strukturální jednotka RNA, dekóduje genetickou informaci tvorbou kodonů a také vytváří poly A ocas RNA.Používá se jako monomerní jednotka při konstrukci RNA, sloužící jako druhý posel v buněčných aktivitách a také pomáhá při zakrývání RNA.Používá se jako monomerní nukleotidy ve struktuře RNA, stimuluje signální transdukční dráhy buněk.Používá se jako důležitý monomer ve struktuře RNA. Vytvářením párů bází přináší stabilitu a zvyšuje účinnost molekul RNA.
Počet vytváření vodíkových vazebDvojité vazbyTrojité vazbyDvojité vazbyTrojité vazby
SynonymaAdenylová kyselina, adenosin 5′-monofosfát, 5′-adenylová kyselina atd.Kyselina 5'-guanidylová, kyselina 5'-guanylová, guanosin 5'-monofosfát atd.kyselina cytidylová, cytidin 5'-monofosfát, cytidylát, cytidin 5'-fosfát;kyselina uridylová; uridin 5'-monofosfát; kyselina 5'-uridylová; uridin 5'-fosfát; uridin fosfát; 5'-UMP; Uridin 5′-kyselina fosforečná atd.
srovnávací analýza mezi všemi nukleotidy ve struktuře RNA

Po srovnání mezi všemi nukleotidy ve struktuře RNA jsme našli některé podobnosti a rozdíly mezi nimi. Analytické informace jsou uvedeny níže -

Definice

  • MPA: AMP je jedním z Strukturní monomerní jednotky RNA. Je to ester adenosinového nukleosidu a kyseliny fosforečné, většinou sloužící jako energetická měna buněk. 
  • SVP: GMP je jednou ze strukturních monomerních jednotek RNA. Je to ester guanosinového nukleosidu a kyseliny fosforečné, většinou používaný jako druhý posel buněk.
  • CMP: CMP je jednou ze strukturních monomerních jednotek RNA. Je to ester cytidinového nukleosidu a kyseliny fosforečné, který pomáhá při přenosu signálu.
  • UMP: UMP je jednou ze strukturních monomerních jednotek RNA. UMP se nachází pouze ve struktuře RNA.

Základní typ

  • MPA: Je to purinový základ.
  • SVP: Je to purinový základ.
  • CMP: Je to pyrimidinová báze.
  • UMP: Je to pyrimidinová báze.

Doplňkový základ

  • AMP: Tvoří komplementární pár bází s uracilem.
  • SVP: Tvoří komplementární pár bází s cytosinem.
  • CMP: Tvoří komplementární pár bází s guaninem.
  • UMP: Tvoří komplementární pár bází s adeninem.

Struktura

  • MPA: Skládá se ze tří jednotek, jako je pětiuhlíkový ribózový cukr, fosfátová skupina a nukleobáze adenin.
  • SVP: Skládá se ze tří jednotek, jako je pětiuhlíkový ribózový cukr, fosfátová skupina a nukleobáze Guanin.
  • CMP: Skládá se ze tří jednotek, jako je pětiuhlíkový ribózový cukr, fosfátová skupina a nukleobáze Cytosin.
  • UMP: Skládá se ze tří jednotek, jako je pětiuhlíkový ribózový cukr, fosfátová skupina a nukleobáze uracil.

Deriváty

  • MPA: Adenosinmonofosfát je derivát adenosintrifosfátu.
  • SVP: Guanosinmonofosfát je derivát guanosintrifosfátu.
  • CMP: Cytidinmonofosfát je derivát cytidintrifosfátu.
  • UMP: Uridinmonofosfát je derivát uridintrifosfátu.

Vzorec

  • MPA: Chemický vzorec AMP je C10H14N5O7P.
  • SVP: Chemický vzorec GMP je C10H14N5O8P.
  • CMP: Chemický vzorec CMP je C9H14N3O8P.
  • UMP: Chemický vzorec UMP je C9H13N2O9P.

Hmota

  • MPA: Molární hmotnost neboli AMP je 347.22 g/mol.
  • SVP: Molární hmotnost neboli GMP je 363.223 g·mol-1.
  • CMP:Molární hmotnost neboli CMP je 323.198 XNUMX g · mol-1.
  • UMP: Molární hmotnost neboli UMP je 324.182 g·mol-1.

Funkce

  • MPA: AMP je jednou ze čtyř monomerních jednotek RNA. Spolu s ostatními nukleotidy tvorbou kodonů kóduje genetické informace, stimuluje proteosyntéza. Vytváří poly A ocas RNA, aby se zabránilo zkracování RNA. Je také zdrojem energie pro buňky.
  • SVP: GMP je jednou ze čtyř monomerních jednotek RNA. Vytvářením kodonů nesou genetickou informaci. Zakrytím RNA zabraňuje rozbití.
  • CMP: CMP je jedním ze čtyř nukleotidů používaných v procesu syntézy RNA. Protože kodony nesou genetickou informaci, stimulují přenos signálu.
  • UMP: UMP je nukleotid používaný v procesu syntézy RNA. Noste v něm genetickou informaci. Pomáhá v procesu překladu.

Počet vytváření vodíkových vazeb

  • MPA: AMP vytváří vodíkové dvojné vazby s uracilem.
  • SVP: Vytváří vodíkové trojné vazby s cytosinem.
  • CMP: CMP tvoří vodíkové trojné vazby s guaninem GMP.
  • UMP: Vytváří vodíkové dvojné vazby s adeninem.

Synonyma

  • MPA: Některá dobře známá synonyma adenosinmonofosfátu jsou kyselina adenosinová, kyselina adenosin-5'-monofosfát, kyselina 5'-adenylová atd.
  • SVP: Některá běžně známá synonyma guanosinmonofosfátu jsou 5′-guanidylová kyselina, 5′-guanylová kyselina, guanosin 5′-monofosfát atd.
  • CMP: Některá běžná synonyma cytidinmonofosfátu jsou kyselina cytidylová, cytidin 5′-monofosfát, cytidylát, cytidin 5′-fosfát atd.
  • UMP: UMP je také známá jako kyselina uridylová; uridin 5'-monofosfát; kyselina 5'-uridylová; uridin 5'-fosfát; uridin fosfát; 5'-UMP; Uridin 5′-kyselina fosforečná atd.
Nukleotid 1

Základní nukleotidová struktura z Wikimedia Commons

Kde se v RNA nacházejí nukleotidy?

Nukleotidy jsou stavební bloky, které se spojují specifickým způsobem a vytvářejí celý polynukleotidový RNA řetězec. 

Fosforečnan jednoho nukleotidu se váže s jiným cukrem, čímž tvoří cukerný fosfátový hlavní řetězec nukleové kyseliny. Ačkoli je RNA jednovláknová struktura, některé komplementární báze se nakonec dostanou do těsného kontaktu a páry vytvoří vlásenkovou smyčku. Tyto strukturní vlastnosti včetně párování bází přinášejí stabilitu a zvyšují účinnost molekul RNA.

Chcete-li se dozvědět více o nukleotidech, přečtěte si náš článek na Příklady nukleotidů: Podrobné statistiky

Jaké nukleotidy se používají v RNA?

V RNA se používají čtyři nukleotidy, jako je adenosinmonofosfát (AMP), guanosinmonofosfát (GMP), cytidinmonofosfát (CMP) a uridinmonofosfát (UMP).

Jaký nukleotid se nachází v RNA a ne v DNA?

DNA a RNA obě nukleové kyseliny jsou tvořeny převážně stejnými nukleotidovými jednotkami, kromě jedné.

Nukleotid uridinmonofosfát neboli UMP je přítomen v RNA, nikoli v DNA. Protože nukleobáze Uracil je přítomen pouze v RNA, v DNA je přítomen ve své methylované verzi, která se nazývá Thymin. Nukleotid tvořený thyminem se nazývá thymidinmonofosfát.

Chcete-li vědět více, přečtěte si náš článek na Adenin vs Thymin: Srovnávací analýza

Jaká je role nukleotidů v syntéze proteinů?

Nukleotidy hrají zásadní roli v proces syntézy bílkovin. Během translace čtou ribozomy molekuly mRNA, složené z nukleotidů, aby shromáždily aminokyseliny do polypeptidového řetězce. Nukleotidy také slouží jako stavební kameny DNA a RNA, uchovávají a přenášejí genetické informace nezbytné pro správnou syntézu bílkovin.

Jak jsou uspořádány nukleotidy v RNA?

Nukleotidy ve struktuře RNA jsou uspořádány specifickým způsobem. 

Nukleotidy, které dekódují genetickou informaci pro syntézu proteinů tvorbou kodonů, jsou přítomny uprostřed vlákna. Na 5′ konci jsou uspořádány guaniny, takže 5′ uzávěr poskytuje ochranu. Na 3' konci nebo v poloze ocasu je připojeno několik adenosinmonofosfátů, což vytváří poly A konec RNA, aby chránil zkrácení.

Složení nukleotidů v RNA?

Nukleotidy jsou obecně ester mezi nukleosidy a kyselinami fosforečnými.

Každý nukleotid má ve své struktuře pěti uhlíkovou ribózovou sacharidovou skupinu, fosfátovou skupinu a jednu ze čtyř nukleobází. Čtyři nukleobáze jsou adenin (A), guanin (G), cytosin (C) a uracil (U).

Adenin a guanin jsou purinové báze. Cytosin a uracil jsou pyrimidiny základny.

obrázky 8

Purinové a pyrimidinové nukleotidy ve struktuře RNA z Wikimedia Commons

Jako celek můžeme říci, že role nukleotidů ve struktuře RNA je nesmírná. Po srovnávací analýza mezi všemi uvádíme některé podobnosti a rozdíly, které se jich týkají. Doufám, že vám tento článek o nukleotidech ve struktuře RNA bude užitečný.

Také čtení: