25 Příklad enzymu ligázy: Podrobná fakta

Slovo „ligáza“ znamená spojit se nebo svázat. Katalyzuje spojení dvou makromolekul tvorbou nových vazeb, jako jsou vazby mezi CO, CN, CS atd.

• Aminoacyl-tRNA ligázy
• Acid-ethanol ligázy
• Olefin beta-lakton syntetáza
• Acid-thiol ligázy
• Acid-amoniakové ligázy
• Peptidové syntázy
• Cykloligázy
• NAD+ syntáza
• Fosforibosylformylglycinamidin syntáza
• Asparagin syntáza
• Karbamoyl-fosfát syntáza
• Asparaginyl-tRNA syntáza
• Glutaminyl-tRNA syntáza
• Pyruvátkarboxyláza
• Acetyl-CoA karboxyláza
• Propionyl-CoA karboxyláza
• Methylkrotonoyl-CoA karboxyláza
• Geranoyl-CoA karboxyláza
• Aceton-karboxyláza
• 2-oxoglutarátkarboxyláza
• Koenzym F430 syntetáza
• DNA ligázy
• RNA ligázy
• Magnesium Chelatase
• kobaltochelatázy
• Ubikvitinové ligázy

Ligáza patří do jedné ze šesti tříd enzymů (enzymatická klasifikace/EC:6).

V biologii je enzym ligáza také označován jako „molekulární lepidlo“ kvůli své vlastnosti spojovat fragmenty DNA tím, že katalyzuje tvorbu fosfodiesterové vazby.

Podívejme se na něco z Ligázy příklady enzymů.

1. Aminoacyl-tRNA ligázy

Vazba uhlík-kyslík se tvoří mezi aminoacyl-tRNA. Tento enzym je životně důležitý pro translaci proteiny na ribozomech pomocí tRNA. Zde „aminoacyl“ označuje individuální aminokyselinu. Existuje asi 25 aminoacyl-tRNA ligáz.

2. Acid-ethanol ligázy

Vazba uhlík-kyslík vzniká mezi kyselými a OH skupinami. Enzym ligáza v této kategorii se také nazývá ester syntázy. Slovo syntázy znázorňuje, že reakce zde může být katalyzována bez použití ATP/energetických výdajů.

3. Olefinové beta-laktonsyntetázy

Tento enzym se nachází v dráze biosyntézy olefinických uhlovodíků.

4. Acid-thiolligázy

Acid-thiol ligasy, jak název napovídá, vazba je tvořena mezi uhlíkem kyselé skupiny a sírou thiolové skupiny. Tyto enzymy se účastní především mastné kyseliny syntéza a sekundární metabolity u živých bytostí.

5. Acid-Amonia Ligases

Jsou široce známé jako amidsyntázy. Katalyzuje ligační reakci mezi kyselinou a amoniakem vytvořením vazby mezi uhlíkem a dusíkem.

6. Peptidové syntázy

Peptidové ligázy se také nazývají, protože katalyzují tvorbu vazby mezi peptidy a proteiny a některým specifickým substrátem. Vazba vzniká mezi uhlíkem a dusíkem

7. Cykloligázy

Katalyzují tvorbu vazeb uhlík-dusík v molekule, čímž dávají vzniknout heterocyklickému kruhu.

8. NAD+ syntázy

Je to zkratka pro nikotin adenindinukleotid syntázy. Vazba uhlík-dusík vzniká mezi třemi důležitými substráty: ATP, NAD a amoniakem.

9. Fosforibosylformylglycinamid syntázy

Katalyzuje reakci vytvořením vazby uhlík-dusík, kde donorovou molekulou je Glutamin.

10. Aspargin syntázy

Je to jeden z úklidových enzymů u savců. Je fyziologicky nezbytný a účastní se cyklu močoviny, kde katalyzuje přeměnu aspartátu na asparagin.

11. Karbamoyl-fosfát syntázy

Katalyzuje tvorbu karbomylfosfátu, což je zásadní krok v biosyntéze pyrimidinu a argininu.

12. Asparginyl-tRNA syntáza

Vytváří vazbu uhlík-kyslík za vzniku L-asparginu. Podílí se také na metabolismu aspartátu a alaninu.

13. Glutaminyl-tRNA syntáza

Patří mezi dvacet t-RNA syntáz, které se podílejí na tvorbě glutaminu.

14. Pyruvátkarboxylázy

Je základním enzymem Krebova cyklu, kde katalyzuje tvorbu oxaloacetátu.

15. Acetyl-CoA karboxylázy

Katalyzuje nevratnou reakci karboxytransferázy za vzniku malonyl-CoA.

16. Propionyl-CoA karboxylázy

Je to zkratka pro PCC. Dysfunkce tohoto enzym vede k metabolismu acidóza.

17. Methylkrotonoyl-CoA karboxylázy

Katalyzuje na ATP dependentní karboxylaci 3-methylkrotonoyl-CoA. Nedostatek tohoto enzymu způsobuje methylkrotonylglycinurii.

18. Geranoylkarboxylázy

Jde o biotin obsahující enzym karboxylázu. Hlásí se hlavně u rostlin a bakterií.

19. Acetonkarboxylázy

Je to typ ATP-dependentní karboxylázy, která katalyzuje tvorbu vazby mezi svým acetonovým substrátem a hydrogenuhličitanovým iontem.

20. 2-oxoglutarátkarboxyláza

Jak název napovídá, pomáhá při tvorbě vazby mezi 2-oxoglutarátem a hydrogenuhličitanovým iontem v přítomnosti ATP.

21. Koenzym F430 syntetázy

Tento enzym má charakteristickou vlastnost, že obsahuje centrum odvozené od tetrapyrrolu.

22. DNA ligázy

Využívá ATP nebo NAD+ k vytvoření fosfodiesterové vazby mezi dvěma bázemi v DNA.

23. RNA ligázy

Tvoří vazbu mezi 3′ hydroxylovou skupinou a 5′ fosfátovou skupinou molekul RNA. A pro tuto reakci potřebuje ATP, který se přeměňuje na AMP.

24. Magnesium Chelatáza

Jeho primární role je v syntéze chlorofylu a bakteriochlorofylu. Pomáhá při vkládání iontů hořčíku do devítijádra porfyrinového komplexu.

25. Kobaltochelatázy

Vytváří vazby dusík-D-kov. Hraje ústřední roli v biosyntetické dráze vitaminu B-12.

26. Ubikvitinové ligázy

Tato ligáza umožňuje přenos ubiquitinu z molekuly nosiče na proteinový substrát. Existují různé typy ubikvitinových ligáz, které jsou substrátově specifické.

Shrnutí

Náš příspěvek shrnul různé příklady enzymů ligázy na základě jejich specifičnosti pro substráty a tvorbu vazby katalyzovanou enzymem ligázou. Lze dojít k závěru, že enzym ligáza se nachází v živých organismech a má aplikace v biotechnologii a průmyslovém výzkumu.

Také čtení:

• Příklady komensalismu
• Funkce mitochondrií rostlinných buněk
• Jsou aktivní nosné proteiny
• Stupně meiózy 2
• Příklady nukleotidů
• Mají bakterie chloroplasty
• Struktura chromozomu hub
• Příklady enzymu transferázy
• Pohyb vody buněčnou stěnou
• Má endoplazmatické retikulum membránu